55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1623 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  41.86 
 
 
452 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  36.14 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  38.1 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  35.64 
 
 
265 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  35.64 
 
 
236 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  35.02 
 
 
247 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  36.24 
 
 
247 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  36.24 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  36.24 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  36.24 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  35.78 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  35.78 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  35.78 
 
 
247 aa  118  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  35.32 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  35.78 
 
 
247 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  30.92 
 
 
480 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  39.82 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  32.26 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  28.97 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  37.3 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  26.76 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  32.45 
 
 
285 aa  72  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  27.59 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1580  hypothetical protein  28.29 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.77857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  30.3 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  27.66 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.62 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  26.36 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  30.13 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1046  hypothetical protein  30.25 
 
 
298 aa  52  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000752842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  24.75 
 
 
418 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  29.17 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1842  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  29.13 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1908  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  29.13 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1861  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  29.13 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.862275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  29.06 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13052  secreted protein TB22.2  25 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  26.96 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1437  hypothetical protein  24.15 
 
 
300 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2092  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  29.82 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4267  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  27.87 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54877  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  26.24 
 
 
335 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  27.64 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  29.41 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  29.41 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  27.64 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2311  hypothetical protein  32.29 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  32.56 
 
 
248 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  43.18 
 
 
333 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  32.56 
 
 
248 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  32.56 
 
 
248 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  25.89 
 
 
256 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>