20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3184 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  773    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  88.95 
 
 		 380 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3314  hypothetical protein  73.61 
 
 		 380 aa  534  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0511788  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  27.36 
 
 		 247 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  30.25 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  26.23 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  28.44 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  28.44 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  26.05 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  28.44 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  26.42 
 
 		 247 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  28.44 
 
 		 247 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  28.44 
 
 		 247 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  25.47 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  28 
 
 		 335 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  29.3 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  27.82 
 
 		 272 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  27.97 
 
 		 236 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>