63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2297 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  96.19 
 
 
236 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  36.14 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  31.7 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  33.05 
 
 
480 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  30.15 
 
 
265 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  31.31 
 
 
452 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  28.82 
 
 
247 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  28.82 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  27.95 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  29.79 
 
 
247 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  42.4 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  28.38 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.5 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  29.74 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  34.2 
 
 
201 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  28.76 
 
 
281 aa  88.2  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  32.62 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  27.95 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  29.57 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  39.34 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  29.3 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  24.05 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  27.8 
 
 
247 aa  68.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  36.8 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1580  hypothetical protein  26.07 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.77857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  31.36 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  27.75 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  19.25 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  25.38 
 
 
285 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  32.79 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  29.82 
 
 
322 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  33.9 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  24.08 
 
 
335 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  28 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1046  hypothetical protein  33.05 
 
 
298 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000752842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  19.81 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  25.41 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  31.3 
 
 
350 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  29.13 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  30 
 
 
323 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0032  hypothetical protein  20.64 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000631349  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1227  hypothetical protein  23.39 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.219903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  28.93 
 
 
248 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  28.93 
 
 
248 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2311  hypothetical protein  25.36 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1437  hypothetical protein  25.5 
 
 
300 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  26.61 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  28.93 
 
 
248 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  26.61 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13052  secreted protein TB22.2  20.38 
 
 
227 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  24.17 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  28.1 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  28.21 
 
 
380 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  29.13 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  22.16 
 
 
274 aa  42.7  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  26.75 
 
 
281 aa  42  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>