23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0546 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  95.56 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  65.32 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  65.73 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  65.32 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  66.8 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  60.48 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  60.08 
 
 		 248 aa  331  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  52.48 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  30 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  26.52 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  28.12 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  21.88 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  26 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  26.63 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  25.36 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  29.92 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  25.56 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  26.98 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  22.73 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  29.13 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>