19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4974 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  95.56 
 
 		 248 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  65.73 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  65.32 
 
 		 248 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  65.73 
 
 		 248 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  66.4 
 
 		 248 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  60.48 
 
 		 248 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  60.08 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  52.48 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  27.62 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  25.28 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  36.51 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  27.34 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  21.09 
 
 		 281 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  25.36 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  25.63 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  26.98 
 
 		 361 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>