36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5701 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  98.79 
 
 
248 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  64.52 
 
 
248 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  62.1 
 
 
248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  62.5 
 
 
248 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  62.5 
 
 
248 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  61.29 
 
 
248 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  60.08 
 
 
248 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  60.08 
 
 
248 aa  310  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  57.02 
 
 
243 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  34.39 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  40.65 
 
 
284 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  38.46 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  29.5 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  27.97 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  25.97 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  25.58 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  31.58 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  22.54 
 
 
251 aa  52  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  30.97 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  30.43 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.27 
 
 
361 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  26.77 
 
 
236 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  27.91 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  26.61 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  28.12 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  28.12 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  25.17 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  25.88 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  27.34 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  27.34 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  27.34 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  27.64 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  27.97 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  28.33 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  21.64 
 
 
452 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>