70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2611 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  96.19 
 
 
236 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  35.64 
 
 
232 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
480 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  30.84 
 
 
253 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  30.13 
 
 
247 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  30.13 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  30.15 
 
 
265 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  31.78 
 
 
452 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  29.26 
 
 
247 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  30.64 
 
 
247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  29.69 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  43.2 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  32 
 
 
315 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  34.72 
 
 
201 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  28.88 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  27.55 
 
 
281 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  36.49 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  28.09 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  30.23 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  32.69 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  39.34 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  28.29 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  30.06 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  25.1 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1580  hypothetical protein  25.62 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.77857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  37.3 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  31.58 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  31.36 
 
 
227 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  24.5 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  33.33 
 
 
370 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  19.92 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  24.62 
 
 
335 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  35.25 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  33.61 
 
 
350 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  27.8 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0032  hypothetical protein  22.02 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000631349  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  24.81 
 
 
256 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1046  hypothetical protein  32.2 
 
 
298 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000752842  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  20.41 
 
 
265 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  28.35 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1227  hypothetical protein  24.24 
 
 
267 aa  49.3  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.219903  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  25.78 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  29.75 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  29.75 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  29.75 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  28.15 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  28.93 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  26.77 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  26.77 
 
 
248 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13052  secreted protein TB22.2  20.28 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190468 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1437  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2311  hypothetical protein  25.36 
 
 
239 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  26.67 
 
 
243 aa  45.1  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  27.5 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  28.27 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  29.92 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1587  hypothetical protein  26.89 
 
 
412 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1861  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  24.79 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.862275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1908  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  24.79 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1842  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  24.79 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4267  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  27.19 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54877  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  27.83 
 
 
380 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12011  immunogenic protein mpt64  21.16 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  42  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>