32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4712 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  100 
 
 
248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  95.97 
 
 
248 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  95.97 
 
 
248 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  95.97 
 
 
248 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  67.74 
 
 
248 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  65.32 
 
 
248 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  65.73 
 
 
248 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  62.5 
 
 
248 aa  337  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  62.1 
 
 
248 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  50.83 
 
 
243 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  32.22 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  37.1 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  35.38 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  24.12 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  26.81 
 
 
281 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  23.2 
 
 
265 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.4 
 
 
239 aa  48.9  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  28.93 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  24.71 
 
 
452 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  28.06 
 
 
271 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  22.14 
 
 
251 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  18.62 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  28.1 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  26.62 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  28.36 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.2 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  25.17 
 
 
247 aa  42  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>