44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2045 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  570  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  46.49 
 
 
284 aa  261  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  32.9 
 
 
264 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  38.46 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  34.84 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  38.46 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  37.69 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  35.38 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  35.38 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  35.71 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  35.38 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  35.38 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  36.51 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  31.94 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  29.58 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  33.07 
 
 
271 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  32.46 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  30.85 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  30.89 
 
 
251 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  33.61 
 
 
361 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  33.08 
 
 
265 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  28.91 
 
 
271 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  27.22 
 
 
247 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  28.65 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  28.65 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  30.16 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  29.07 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  29.07 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  31.67 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  32 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  28.07 
 
 
247 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  29.17 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  25.55 
 
 
480 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  25.73 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  28.82 
 
 
315 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  23.94 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  23.95 
 
 
201 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  25.83 
 
 
239 aa  46.2  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  25.41 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  27.5 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  27.2 
 
 
452 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  22.16 
 
 
236 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>