34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4973 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  100 
 
 		 248 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  97.98 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  97.98 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  95.97 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  68.42 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  65.73 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  65.73 
 
 		 248 aa  348  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  61.69 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  61.29 
 
 		 248 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  49.59 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  32.22 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  38.71 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  35.38 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  23.94 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  26.09 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  24 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.4 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  29.75 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  30.2 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  27.34 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  20 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  24.14 
 
 		 452 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  28.93 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  21.43 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  29.53 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  27.34 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.2 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  25.87 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  35.14 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  32.56 
 
 		 232 aa  42  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>