51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0885 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  29.12 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  32.82 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  28.92 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  30.18 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  26.99 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  33.61 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  27.86 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  32.5 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  28.27 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  26.2 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  24.84 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  22.89 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  26.81 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  30.51 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  26.81 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  29.75 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  26.09 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  31.01 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  30.17 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  30.08 
 
 		 247 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1587  hypothetical protein  21.67 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  28.99 
 
 		 253 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  29.92 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 248 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  27.27 
 
 		 248 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  26.55 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  28.46 
 
 		 315 aa  46.2  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  27.46 
 
 		 263 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  30.47 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  27.2 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  27.05 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  27.2 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  27.2 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  27.2 
 
 		 248 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  27.83 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  27.2 
 
 		 248 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  31.25 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  26.36 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3593  hypothetical protein  26.02 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  28.35 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  28.12 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>