21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0494 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0494  putative lipoprotein  100 
 
 		 248 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  68.42 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  68.15 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  67.74 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  68.15 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0546  putative lipoprotein  66.8 
 
 		 248 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4974  lipoprotein, putative  66.4 
 
 		 248 aa  344  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  64.78 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  64.52 
 
 		 248 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  50.41 
 
 		 243 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  31.8 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  29.23 
 
 		 284 aa  92  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  37.69 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  32.81 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  28.99 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  31.01 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  23.74 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  31.75 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  30.15 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  29.5 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  23.13 
 
 		 452 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>