52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0098 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  486  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  27.42 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  24.31 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  26.38 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  29.44 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  29.44 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  26.95 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  32.79 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  35.25 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  24.7 
 
 
247 aa  58.9  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  24.06 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  26.48 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  26.62 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  26.98 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  26.98 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  25.41 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  26.98 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  21.79 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  24.51 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  27.64 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  27.64 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  29.69 
 
 
480 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  26.87 
 
 
215 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  28 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  29.37 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  29.69 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  24.39 
 
 
315 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65720  putative lipoprotein  31.86 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  25.4 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  26.98 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5701  lipoprotein  30.97 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1842  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  21.7 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1908  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  21.7 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1861  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  21.7 
 
 
232 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.862275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4973  lipoprotein  26.4 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  25.19 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4712  lipoprotein  26.4 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4920  putative lipoprotein  27.08 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94223  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  26.19 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4796  hypothetical protein  27.08 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  25.57 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  28.69 
 
 
418 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  25.83 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  25.31 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  27.62 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  24.83 
 
 
452 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2663  hypothetical protein  22.22 
 
 
293 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0705071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  26.4 
 
 
380 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1580  hypothetical protein  23.58 
 
 
303 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.77857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00669  hypothetical protein  22.88 
 
 
222 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  26.83 
 
 
370 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>