48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0631 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  49.33 
 
 
258 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  46.6 
 
 
335 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  27.03 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0767  hypothetical protein  26.67 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0749  hypothetical protein  26.67 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  29.25 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  29.69 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  24 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  28.23 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  26.86 
 
 
281 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  25.79 
 
 
384 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  24.81 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1924  hypothetical protein  25.79 
 
 
263 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139586  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  26.02 
 
 
418 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  21.91 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  21.91 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  21.91 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  25.41 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3541  hypothetical protein  27.78 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  26.32 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  21.91 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  21.91 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2036  hypothetical protein  26.7 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2095  hypothetical protein  25.95 
 
 
378 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2239  hypothetical protein  27.03 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16446  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  22.75 
 
 
386 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  25.83 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  22.58 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3020  hypothetical protein  28.06 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  24.48 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  22.28 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  21.74 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  20.79 
 
 
247 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  23.27 
 
 
247 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4412  hypothetical protein  27.17 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.578011  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1074  hypothetical protein  36.99 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  27.39 
 
 
264 aa  45.4  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2663  hypothetical protein  27.16 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0705071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2639  hypothetical protein  29.46 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  27.2 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  20.9 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  25.58 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  21.32 
 
 
370 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  27.13 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  25.56 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  22.05 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  25.17 
 
 
350 aa  42.4  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>