49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1942 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
480 aa  981    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  33.05 
 
 
236 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  30.38 
 
 
452 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  32.27 
 
 
247 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  32.27 
 
 
247 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  32.27 
 
 
247 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  32.27 
 
 
247 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  27.63 
 
 
253 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  31.87 
 
 
247 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  31.13 
 
 
247 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  38.16 
 
 
247 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  28.12 
 
 
247 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  31.13 
 
 
247 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  27.64 
 
 
265 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  30.92 
 
 
232 aa  87.8  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  30.08 
 
 
247 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  29.77 
 
 
227 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.93 
 
 
315 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  26.64 
 
 
210 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  27.91 
 
 
247 aa  57.4  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  29.69 
 
 
239 aa  57  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  35.04 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  27.07 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1594  hypothetical protein  31.73 
 
 
186 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000225825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  26.74 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  23.08 
 
 
281 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  34.55 
 
 
233 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1843  hypothetical protein  32.61 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  29.55 
 
 
201 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  29.89 
 
 
197 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  28.87 
 
 
215 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  25.55 
 
 
274 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  29.25 
 
 
227 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  26.06 
 
 
322 aa  47.8  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2092  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  26.77 
 
 
244 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  23.5 
 
 
271 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  27.69 
 
 
271 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  31.07 
 
 
259 aa  47  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0032  hypothetical protein  27.91 
 
 
236 aa  47  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000631349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  20.36 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4267  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  28.46 
 
 
244 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1861  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  26.98 
 
 
232 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.862275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1908  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  26.98 
 
 
232 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1842  immunogenic protein MPB64/MPT64 precursor  26.98 
 
 
232 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0901  copper amine oxidase domain protein  26.98 
 
 
338 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00103943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  29.63 
 
 
298 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  32.46 
 
 
216 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>