63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0901 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0901  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 		 338 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00103943  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5499  hypothetical protein  43.83 
 
 		 164 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.103854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1885  hypothetical protein  36.89 
 
 		 203 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.076052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  38 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  35.85 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  29.82 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  38.83 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  37.37 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  29.82 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  33.94 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  37.62 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.97 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  42.5 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  32.73 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  38.68 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 		 480 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  41.77 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  34.91 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  42.11 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  42.68 
 
 		 495 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  27.93 
 
 		 521 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 		 269 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  33.91 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  41.33 
 
 		 732 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  36.36 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  34.78 
 
 		 591 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  37.04 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  34.58 
 
 		 845 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  33.64 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  25.21 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  37.08 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  33.01 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1228  copper amine oxidase-like  30.09 
 
 		 559 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.27 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  30 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.69 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 784 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 741 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  32.65 
 
 		 535 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0480  copper amine oxidase domain-containing protein  33.75 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000283762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  29 
 
 		 514 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  30.47 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  31.15 
 
 		 529 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1234  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.77 
 
 		 437 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  33.33 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  36.11 
 
 		 113 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.51 
 
 		 907 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  26.98 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  23.23 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 650 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  26.42 
 
 		 574 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  30.34 
 
 		 549 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  33.6 
 
 		 541 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  32.91 
 
 		 948 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  27 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  32.2 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>