39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3237 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  34.01 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  32.82 
 
 
247 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  32.99 
 
 
247 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  33.16 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  36.2 
 
 
253 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  33.17 
 
 
315 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  32.31 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  39.34 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  26.77 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  39.34 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  26.76 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  25.77 
 
 
452 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0593  hypothetical protein  28.36 
 
 
335 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000608871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  24 
 
 
256 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1108  endo-1,4-beta-xylanase-like protein  23.66 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.591273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  28.87 
 
 
480 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  30.83 
 
 
350 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  24.24 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  31.82 
 
 
370 aa  55.5  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  26.87 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  26.87 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  29.41 
 
 
227 aa  48.5  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  25.14 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1437  hypothetical protein  26.79 
 
 
300 aa  45.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  24.83 
 
 
281 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  24.38 
 
 
271 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0711  hypothetical protein  23.91 
 
 
247 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  25.32 
 
 
418 aa  45.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  26.32 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  24.49 
 
 
271 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2574  hypothetical protein  27.49 
 
 
285 aa  42  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.829838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>