31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2143 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0057  hypothetical protein  42.69 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14990  putative anti-SigV factor  35.93 
 
 
197 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.008664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  34.72 
 
 
236 aa  91.7  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  34.2 
 
 
236 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  37.3 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2311  hypothetical protein  31.43 
 
 
239 aa  72  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  29.05 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  35.16 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  29.05 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  34.38 
 
 
247 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  26.62 
 
 
265 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  35.54 
 
 
247 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  35.54 
 
 
247 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  35.54 
 
 
247 aa  61.6  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  35.54 
 
 
247 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  27.72 
 
 
452 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  28.49 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  28.49 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  29.41 
 
 
315 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  23.75 
 
 
247 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  31.4 
 
 
247 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  29.55 
 
 
480 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  23.95 
 
 
274 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1894  hypothetical protein  24.38 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  25.68 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  24.12 
 
 
284 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0032  hypothetical protein  25.93 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000631349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67906  Sulfite reductase [NADPH] beta subunit (Extracellular matrix protein 17)  27.91 
 
 
934 aa  41.2  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0700093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>