31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1278 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  471  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4194  hypothetical protein  31.01 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  29.23 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  28.46 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  27.69 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  27.69 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  27.41 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  29.77 
 
 
480 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  25.76 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  30.53 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  25.56 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1623  hypothetical protein  26.36 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.377971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3237  hypothetical protein  27.07 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  25.84 
 
 
418 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  26.09 
 
 
251 aa  48.9  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2905  hypothetical protein  23.94 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  23.21 
 
 
271 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  28.85 
 
 
322 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0631  hypothetical protein  20.9 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3314  hypothetical protein  26.72 
 
 
380 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0511788  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  26.5 
 
 
380 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1046  hypothetical protein  31.06 
 
 
298 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000752842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2143  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.898454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>