17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1184 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  542  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2045  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.242131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0423  hypothetical protein  23.79 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  27.67 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0079  hypothetical protein  25.48 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00271867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0758  hypothetical protein  26.24 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0543513  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  30.51 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  22.18 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44590  hypothetical protein  23.42 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  22.66 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  20.71 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0805  hypothetical protein  22.31 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5143  hypothetical protein  26.96 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  23.87 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>