51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2073 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  536  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  35.64 
 
 		 339 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  38.55 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  29.41 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  42.31 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  28.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  28.23 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  36.96 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  30.3 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  30.23 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  24.48 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  31.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  29.91 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  28.89 
 
 		 193 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  23.73 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  31.51 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  33.66 
 
 		 315 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  32.56 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  29.41 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  30.56 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  32.58 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  36.05 
 
 		 109 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  36.05 
 
 		 109 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  36.05 
 
 		 109 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  36.05 
 
 		 109 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  36.05 
 
 		 109 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  28.04 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  30.91 
 
 		 877 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  30.53 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  27.71 
 
 		 100 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  30.84 
 
 		 111 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  28.74 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  28.7 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  28.87 
 
 		 341 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  33.71 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4997  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.1 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  28.42 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  24.42 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  32.58 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4327  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4222  tetratricopeptide TPR_2  34.92 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.356842  normal  0.550673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  28.09 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  29.35 
 
 		 479 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  35.29 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  26.19 
 
 		 197 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>