53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0112 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  82.84 
 
 		 206 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  83.82 
 
 		 206 aa  352  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  72.04 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  76.04 
 
 		 212 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  75.39 
 
 		 212 aa  317  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  75.39 
 
 		 212 aa  317  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  64.09 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  60.8 
 
 		 193 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  63.43 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  56.25 
 
 		 196 aa  214  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  77.42 
 
 		 128 aa  204  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  50.79 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  52.41 
 
 		 356 aa  174  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  42.08 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  42.78 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  44.05 
 
 		 214 aa  138  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  35.83 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  32.11 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  33.52 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  45.74 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  29.87 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.56 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  29.63 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  31.67 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  40.43 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30.4 
 
 		 446 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  34.41 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  35.56 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  33.33 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  29.91 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  29.47 
 
 		 132 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  31.33 
 
 		 100 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2965  hypothetical protein  42.11 
 
 		 340 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  32.97 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  30.51 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  31.78 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.31 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.83 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  29.82 
 
 		 479 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  28.04 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  30.61 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  31.11 
 
 		 341 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  31.37 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  28.87 
 
 		 462 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  28.46 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.61 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  50 
 
 		 339 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  35.19 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  26.67 
 
 		 123 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>