46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0017 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  48.51 
 
 		 418 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  48.04 
 
 		 275 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  48.04 
 
 		 390 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  48.04 
 
 		 373 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  48.04 
 
 		 406 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  48.04 
 
 		 371 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  48.04 
 
 		 377 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  48.04 
 
 		 385 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  39.42 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  40.86 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  39.62 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  35.45 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  35.45 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  35.45 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  35.45 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  35.45 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  38.61 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  37.27 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  38.54 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  40.43 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  36.46 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  30.21 
 
 		 245 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  29.79 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  30.21 
 
 		 245 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  30.21 
 
 		 245 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.58 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  31.86 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  37.36 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  33.72 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  32.95 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  31.82 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.04 
 
 		 339 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  33.63 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  34.09 
 
 		 479 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  36.26 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  32.97 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.75 
 
 		 446 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  31.96 
 
 		 341 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  32.2 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  34.31 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  32.97 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  29.81 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  32.97 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>