76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0360 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  236  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  48.65 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  48.65 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  48.65 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  48.65 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  48.65 
 
 
109 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  56.19 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  59.76 
 
 
111 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  51.09 
 
 
132 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  46.79 
 
 
123 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  45.71 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  45.13 
 
 
117 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  43.36 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  52.44 
 
 
113 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  52.44 
 
 
113 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  43.62 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  46.59 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  41.03 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  41.94 
 
 
462 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  39.81 
 
 
339 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  39.24 
 
 
463 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  39.58 
 
 
341 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  37.89 
 
 
479 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  42.17 
 
 
334 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.69 
 
 
315 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.23 
 
 
446 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  36.47 
 
 
306 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  36.45 
 
 
222 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  33.68 
 
 
351 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  35.29 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  36.47 
 
 
307 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  30.19 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  38.27 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2870  protein of unknown function DUF1311  39.09 
 
 
333 aa  51.6  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  34.38 
 
 
245 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  33.64 
 
 
192 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  42.39 
 
 
406 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  31.37 
 
 
877 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  41.3 
 
 
385 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  41.3 
 
 
390 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2826  twin-arginine translocation pathway signal  32.48 
 
 
434 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  35.92 
 
 
497 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  25.62 
 
 
206 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  41.3 
 
 
275 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  41.3 
 
 
373 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  41.3 
 
 
371 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  41.3 
 
 
377 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  42.86 
 
 
418 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  38.27 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  33.96 
 
 
262 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  29.57 
 
 
254 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  26.92 
 
 
212 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  31.43 
 
 
197 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  32 
 
 
231 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  35.29 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  32.14 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  32.14 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  25.49 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  29.21 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  28.16 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  31.37 
 
 
254 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0112  hypothetical protein  24.41 
 
 
207 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  26.09 
 
 
212 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  27.88 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  27.52 
 
 
208 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  32.41 
 
 
206 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  27.73 
 
 
266 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  26.36 
 
 
211 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  29.59 
 
 
277 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  24.56 
 
 
212 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  31.63 
 
 
266 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  24.56 
 
 
212 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  30.28 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  26.92 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>