48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3702 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  42.71 
 
 
192 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  41.67 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.85 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  36.36 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  43.06 
 
 
570 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  37.5 
 
 
295 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  37.11 
 
 
166 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  36.36 
 
 
244 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4308  hypothetical protein  40.28 
 
 
413 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  38.1 
 
 
339 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  41.25 
 
 
245 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4470  putative lipoprotein  41.56 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5833  putative lipoprotein  41.56 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.077855  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3898  putative lipoprotein  41.56 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  31.73 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  29.17 
 
 
277 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.04 
 
 
339 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  30 
 
 
446 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  36.47 
 
 
306 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  28.44 
 
 
212 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  29.36 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  30.84 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  30.84 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  30.84 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  30.84 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  30.84 
 
 
109 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  33.66 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  28.95 
 
 
877 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4274  hypothetical protein  34.12 
 
 
283 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.162287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0108  hypothetical protein  27.12 
 
 
206 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  31.31 
 
 
341 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  30.77 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37.04 
 
 
334 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  29.73 
 
 
132 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0113  hypothetical protein  27.12 
 
 
128 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.785467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  32.1 
 
 
463 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  27.52 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  34.34 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  27.52 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  32.22 
 
 
111 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  28.42 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  29.81 
 
 
211 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  34.83 
 
 
254 aa  41.2  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>