23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2967 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.03291  normal  0.134443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1653  hypothetical protein  28.8 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.186504  normal  0.287849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  26.4 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  26.98 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  27.2 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  27.2 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  27.2 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  25.6 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5565  hypothetical protein  29.6 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  30.63 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  30.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  30.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  30.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  27.78 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  30.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  26.19 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  28.71 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  29.35 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4459  hypothetical protein  34.44 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  27.27 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  26.6 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  26.6 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  31.9 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>