58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30650 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30650  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  55.14 
 
 
133 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  42.4 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  41.6 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  41.6 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  43.7 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  31.62 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02014  hypothetical protein  31.62 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  44.32 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2187  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.063502  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0818  hypothetical protein  35.42 
 
 
181 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2195  hypothetical protein  30.83 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  37.25 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  30.58 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  35.21 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  30.47 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5211  hypothetical protein  34.21 
 
 
131 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  34.09 
 
 
293 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  38.1 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1217  putative secreted protein  31.76 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.446531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  31.76 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  31.76 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  31.76 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  31.76 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0365  protein of unknown function DUF1311  39.74 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.12825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  30.49 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  32.46 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5226  hypothetical protein  30.66 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545011  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2321  hypothetical protein  35 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.395744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4900  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  0.436154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2138  hypothetical protein  25.2 
 
 
129 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268038  normal  0.206157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  30.49 
 
 
131 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0997  putative lipoprotein  28.57 
 
 
258 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3256  protein of unknown function DUF1311  31.87 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.591181  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  33.33 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  30.68 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  29.13 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  31.03 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0885  putative lipoprotein  28.57 
 
 
258 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  29.35 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  30.43 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  29.35 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  32.26 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  35.56 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0307  hypothetical protein  27.82 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0330  hypothetical protein  28.47 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4247  hypothetical protein  31.93 
 
 
134 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0712  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3309  protein of unknown function DUF1311  30.53 
 
 
135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0328  hypothetical protein  27.82 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.355398  normal  0.357964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0482  hypothetical protein  34.88 
 
 
226 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  31.09 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5990  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4364  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765035  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3053  protein of unknown function DUF1311  29.47 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.460673  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4003  hypothetical protein  30.71 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.806978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  29.89 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4257  hypothetical protein  36.49 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>