37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3634 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3634  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1024  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1151  protein of unknown function DUF1311  36 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0956  protein of unknown function DUF1311  33.71 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.622923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1738  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4365  hypothetical protein  41 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0848  hypothetical protein  37.14 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0821  hypothetical protein  37.14 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163557  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0862  hypothetical protein  35.24 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4451  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.710993  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3302  hypothetical protein  28.9 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861345  normal  0.991534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1748  hypothetical protein  32 
 
 		 119 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1480  hypothetical protein  30.69 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.947904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4773  hypothetical protein  24.55 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1841  hypothetical protein  30.58 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.304694  normal  0.532722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3022  hypothetical protein  33.71 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  0.207775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.953868  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4780  hypothetical protein  31.15 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.533353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0496  hypothetical protein  31.3 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1768  hypothetical protein  30.85 
 
 		 135 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3894  hypothetical protein  28.45 
 
 		 134 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3085  hypothetical protein  33.62 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3635  hypothetical protein  28.46 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.218364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3773  hypothetical protein  34.67 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.574363  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  25.84 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5207  hypothetical protein  32.05 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3253  protein of unknown function DUF1311  25.61 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0554  protein of unknown function DUF1311  27.72 
 
 		 293 aa  41.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1843  hypothetical protein  33.8 
 
 		 128 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1197  hypothetical protein  32.98 
 
 		 131 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08272  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2486  hypothetical protein  30 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.635228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2033  lipoprotein, putative  32.39 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151249  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1232  putative secreted protein  32.98 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.565671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1187  putative secreted protein  32.98 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.252053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1082  putative secreted protein  32.98 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>