19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3476 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3476  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1021  hypothetical protein  90.09 
 
 
248 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.618094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2185  hypothetical protein  58.71 
 
 
237 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0390408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5762  hypothetical protein  49.59 
 
 
279 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1820  hypothetical protein  51.26 
 
 
271 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2431  hypothetical protein  51.26 
 
 
271 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2436  hypothetical protein  51.26 
 
 
271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16266  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0862  hypothetical protein  54.9 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00844631  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2297  hypothetical protein  54.15 
 
 
242 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2989  hypothetical protein  54.15 
 
 
242 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0716  hypothetical protein  54.15 
 
 
240 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.674461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1059  hypothetical protein  54.15 
 
 
236 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1065  hypothetical protein  54.15 
 
 
240 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1610  hypothetical protein  54.15 
 
 
240 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0863  hypothetical protein  51.91 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1217  hypothetical protein  53.03 
 
 
199 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2344  hypothetical protein  48.36 
 
 
276 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.195051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2478  hypothetical protein  48.15 
 
 
267 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3576  protein of unknown function DUF1311  29.41 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>