18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2478 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2478  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  530  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2344  hypothetical protein  98.13 
 
 
276 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.195051 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5762  hypothetical protein  87.89 
 
 
279 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1820  hypothetical protein  83.15 
 
 
271 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.297169  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2431  hypothetical protein  83.15 
 
 
271 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2436  hypothetical protein  86.89 
 
 
271 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16266  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0863  hypothetical protein  77.47 
 
 
265 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2297  hypothetical protein  63.14 
 
 
242 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2989  hypothetical protein  63.14 
 
 
242 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0716  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.674461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0862  hypothetical protein  62.71 
 
 
238 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00844631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1059  hypothetical protein  63.14 
 
 
236 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1065  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.811822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1610  hypothetical protein  63.14 
 
 
240 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1217  hypothetical protein  61.74 
 
 
199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1021  hypothetical protein  50.57 
 
 
248 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.618094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3476  hypothetical protein  50.95 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2185  hypothetical protein  45.96 
 
 
237 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0390408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>