61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1496 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1496  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  226  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1775  hypothetical protein  99.12 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263235  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1497  hypothetical protein  93.81 
 
 		 113 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  69.07 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1461  hypothetical protein  58.51 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536177  normal  0.20615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1362  hypothetical protein  55.21 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2487  hypothetical protein  51.65 
 
 		 99 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.767193  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  53.04 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  53.61 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  45.37 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1337  putative secreted protein  47.12 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.040885 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1353  putative secreted protein  47.12 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.925839  normal  0.442542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1315  putative secreted protein  47.12 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1948  putative secreted protein  47.12 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2130  hypothetical protein  47.12 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  54.43 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1900  hypothetical protein  44.44 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.471809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0407  hypothetical protein  43.3 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0853  hypothetical protein  42.27 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166652  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1849  hypothetical protein  42.27 
 
 		 385 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  39.42 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2117  hypothetical protein  42.27 
 
 		 377 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1143  hypothetical protein  42.27 
 
 		 373 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0317  hypothetical protein  42.27 
 
 		 371 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1756  hypothetical protein  42.27 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2167  hypothetical protein  42.27 
 
 		 418 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36.25 
 
 		 463 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0017  hypothetical protein  35.96 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  41.84 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  40.21 
 
 		 341 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  41.38 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  39.8 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  35.71 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.02 
 
 		 339 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  36.19 
 
 		 254 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  33.66 
 
 		 203 aa  53.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  39.29 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5844  hypothetical protein  39.18 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.914244 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0722  hypothetical protein  33.63 
 
 		 877 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  30.39 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  31 
 
 		 277 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2073  hypothetical protein  34.34 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  35.24 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  31.33 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  31.18 
 
 		 307 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  38.14 
 
 		 497 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  33.71 
 
 		 254 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  29.67 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  32.35 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  31.11 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  35.63 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.75 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  32.35 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  28.24 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  36.08 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3694  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560567  normal  0.0810528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  27.68 
 
 		 446 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  32.41 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4415  hypothetical protein  31.37 
 
 		 307 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>