29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1321 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  840    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02135  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003178  hypothetical protein  36.04 
 
 
138 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003175  hypothetical protein  35.14 
 
 
138 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  38.2 
 
 
197 aa  57  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  31.39 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  27.08 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  32.61 
 
 
356 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  36.9 
 
 
463 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37.35 
 
 
334 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  38.46 
 
 
296 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  37.93 
 
 
306 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  34.38 
 
 
132 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  34.44 
 
 
245 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  32.95 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2398  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  34.44 
 
 
245 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  34.44 
 
 
211 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  32 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  26.52 
 
 
192 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  35.44 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  30.95 
 
 
497 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  34.44 
 
 
245 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  31.76 
 
 
206 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  33.71 
 
 
100 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  29.21 
 
 
339 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0626  hypothetical protein  28.85 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  32.5 
 
 
351 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>