45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3068 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  99.58 
 
 		 240 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  84.03 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  46.37 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  35.22 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  38.05 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  38.38 
 
 		 290 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  36.06 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  39.64 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  37.93 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  39.64 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  29.67 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  29.71 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  31.33 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  27 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  30.05 
 
 		 437 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  26.5 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  26.23 
 
 		 417 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  33.59 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  29.76 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  27.6 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  29.45 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  30.38 
 
 		 576 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  28.49 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  37.08 
 
 		 351 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  30.52 
 
 		 439 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  24.37 
 
 		 407 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  34.41 
 
 		 387 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  31.3 
 
 		 322 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  33.08 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  26.75 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  31.54 
 
 		 296 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  30.25 
 
 		 560 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  29.41 
 
 		 566 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04779  hypothetical protein  38.71 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  32.09 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  32.31 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  25.61 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  26.49 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  30.28 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  25.87 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  33.7 
 
 		 351 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  30.08 
 
 		 481 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>