33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4663 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  48.46 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  48.98 
 
 		 446 aa  267  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  55.63 
 
 		 444 aa  260  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  54.51 
 
 		 416 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  39.51 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  39.49 
 
 		 285 aa  90.9  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  30.89 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  28.9 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  31.86 
 
 		 233 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  36.67 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  32.09 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4155  hypothetical protein  31.37 
 
 		 240 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126669 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  27.81 
 
 		 224 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  37.89 
 
 		 263 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  27.91 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  36.84 
 
 		 273 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  35.79 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  27.91 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  29.11 
 
 		 278 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  30.19 
 
 		 245 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  34.04 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  28.28 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  33.01 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  34.58 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 234 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  38.38 
 
 		 211 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3418  hypothetical protein  28.89 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01542  hypothetical protein  32.22 
 
 		 236 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>