17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1472 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  62.79 
 
 		 226 aa  296  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3418  hypothetical protein  55.4 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  46.95 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01542  hypothetical protein  29.78 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3018  hypothetical protein  31.45 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02487  hypothetical protein  26.05 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  27.62 
 
 		 445 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  27.62 
 
 		 446 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  32.61 
 
 		 481 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  26.53 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  30.59 
 
 		 273 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  24.78 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  24.37 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  34.38 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  26.09 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  29.41 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>