19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3018 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3018  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  31.45 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  33.12 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01542  hypothetical protein  51.61 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3418  hypothetical protein  32.76 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02487  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  30.72 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8810  hypothetical protein  31.88 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  29.13 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  28.24 
 
 		 537 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5774  hypothetical protein  31.88 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  34.33 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  26.14 
 
 		 537 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.9 
 
 		 1004 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  26.14 
 
 		 537 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  30.23 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  45.76 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  39.06 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  32.63 
 
 		 273 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>