29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4146 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  100 
 
 		 537 aa  1070    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  100 
 
 		 537 aa  1070    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  74.49 
 
 		 537 aa  810    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  32.89 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  39.74 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  34.16 
 
 		 285 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  28.97 
 
 		 445 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  29.43 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  28.28 
 
 		 446 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  31.94 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  30.9 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  29.63 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  28.3 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  29.94 
 
 		 273 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0194  hypothetical protein  35.37 
 
 		 224 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  28.12 
 
 		 268 aa  50.1  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.92 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  34.44 
 
 		 211 aa  47.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  33.04 
 
 		 273 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.55 
 
 		 278 aa  47  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  35.64 
 
 		 275 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  31.31 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  31.3 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0921  hypothetical protein  25 
 
 		 141 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3023  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0462  hypothetical protein  24.63 
 
 		 243 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  29.13 
 
 		 351 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  24.14 
 
 		 199 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  34.41 
 
 		 302 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>