24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1489 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  64.25 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  28.92 
 
 		 358 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  33.61 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1892  hypothetical protein  36.78 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  29.57 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  33.72 
 
 		 302 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  29.3 
 
 		 439 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  34.44 
 
 		 537 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  34.44 
 
 		 537 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  32 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  30.63 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  27.52 
 
 		 273 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  31.09 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  27.63 
 
 		 290 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  27.43 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  36.36 
 
 		 302 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  31 
 
 		 263 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  28.89 
 
 		 566 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  32.22 
 
 		 537 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  30.06 
 
 		 560 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  29.25 
 
 		 445 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  34.44 
 
 		 446 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  30.4 
 
 		 275 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>