18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1329 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  64.25 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  30.63 
 
 		 358 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  28.5 
 
 		 417 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  28.1 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  32.09 
 
 		 445 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  32.09 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  32.09 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  32.09 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  40.74 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  25.99 
 
 		 278 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  30.4 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  30.77 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  27.44 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  26.75 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  30.13 
 
 		 439 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  30.36 
 
 		 566 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  24.26 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>