36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0811 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  544  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  30.22 
 
 		 417 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  35.33 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  35.5 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  35.56 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  32.32 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  31.43 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  31.9 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  35.29 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  38.28 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  34.75 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  31.33 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  29.52 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  31.33 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  29.8 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  32.12 
 
 		 537 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  26.8 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  27.92 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  32.61 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  36.96 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  28.92 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  29.37 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  39.71 
 
 		 416 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  30.77 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  35.64 
 
 		 537 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  30.36 
 
 		 445 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  35.64 
 
 		 537 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  34.07 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  30.71 
 
 		 302 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  32.71 
 
 		 481 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1329  hypothetical protein  26.75 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000146191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  27.37 
 
 		 387 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  27.01 
 
 		 351 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  27.82 
 
 		 439 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  33.7 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>