35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1755 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  41.75 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  30.14 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  28.27 
 
 		 560 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  30.14 
 
 		 417 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  26.11 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  24.63 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  29.44 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  27.69 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  31.16 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  26.74 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  28.88 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  30.06 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  38.28 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  25.56 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  28.44 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  27.86 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  27.5 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  25.27 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  27.81 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  29.71 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  29.51 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  29.2 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  25.19 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  26.82 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.52 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  28.86 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  30.14 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  30.28 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  30.5 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  30.49 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  26.12 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  30 
 
 		 446 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  29.44 
 
 		 445 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>