24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1526 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  52.97 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  50.27 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  33.99 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  31.45 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  32.47 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  26.16 
 
 		 439 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  28.48 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  27.5 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  27.63 
 
 		 258 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  28.07 
 
 		 290 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04779  hypothetical protein  31.4 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  33.68 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  32.31 
 
 		 240 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  32.31 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  36.99 
 
 		 268 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.59 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  22.29 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  25.98 
 
 		 262 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.83 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  26.62 
 
 		 437 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  25 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  25.79 
 
 		 302 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>