22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1106 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  84.85 
 
 		 199 aa  349  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  82.91 
 
 		 199 aa  344  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  58.59 
 
 		 203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  39.07 
 
 		 680 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  36.09 
 
 		 668 aa  131  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3060  hypothetical protein  30.3 
 
 		 332 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0559  hypothetical protein  29.59 
 
 		 332 aa  99  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  29.75 
 
 		 258 aa  94.7  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  32.26 
 
 		 367 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0277  hypothetical protein  25.77 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  26.19 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  25.43 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  21.57 
 
 		 537 aa  48.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  26.16 
 
 		 302 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  22.29 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  21.05 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  24.16 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  23.57 
 
 		 576 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>