149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3647 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  72.39 
 
 		 668 aa  1006    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 680 aa  1410    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  48.59 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  31.63 
 
 		 670 aa  184  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.15 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.33 
 
 		 688 aa  170  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  30.2 
 
 		 693 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.79 
 
 		 475 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  41.04 
 
 		 203 aa  147  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  42.71 
 
 		 740 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  38.99 
 
 		 199 aa  142  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  38.36 
 
 		 199 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 		 480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  39.07 
 
 		 199 aa  135  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 		 203 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 539 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  27.19 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  26.56 
 
 		 535 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  26.56 
 
 		 535 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  28.82 
 
 		 521 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  25.5 
 
 		 540 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  26.61 
 
 		 539 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  25.81 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  25.43 
 
 		 612 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  25.64 
 
 		 511 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  26.75 
 
 		 533 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  25.87 
 
 		 527 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  25.28 
 
 		 549 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  26.8 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  26.11 
 
 		 507 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.86 
 
 		 258 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  25.85 
 
 		 513 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  24.51 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 645 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  26.27 
 
 		 508 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  32.95 
 
 		 656 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  24.85 
 
 		 532 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 477 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  26.96 
 
 		 502 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  34.73 
 
 		 367 aa  101  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 480 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 503 aa  97.8  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0559  hypothetical protein  34.19 
 
 		 332 aa  90.9  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  29.13 
 
 		 538 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  28.7 
 
 		 545 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.69 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0277  hypothetical protein  42.99 
 
 		 234 aa  85.9  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3060  hypothetical protein  32.26 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  23.54 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.07 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  22.65 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 		 505 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  23.29 
 
 		 675 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  26.88 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  24.52 
 
 		 515 aa  70.5  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  22.26 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  22.26 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  22.26 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  21.57 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  22.55 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  22.11 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  24.89 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  23.15 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  22.08 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  23.01 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  22.15 
 
 		 533 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  22.15 
 
 		 508 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  22.15 
 
 		 508 aa  62  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  24.09 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  24.14 
 
 		 504 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1813  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  26.17 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  29.63 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  22.2 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48996  prolyl aminopeptidase  27.4 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.750097  normal  0.224061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.05 
 
 		 597 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  27.11 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  25.29 
 
 		 278 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  25.96 
 
 		 505 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  21.74 
 
 		 524 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  21.05 
 
 		 506 aa  54.3  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  22.25 
 
 		 572 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  26.75 
 
 		 571 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  29.95 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  21.63 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  22.62 
 
 		 521 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  30.37 
 
 		 263 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  21.77 
 
 		 515 aa  52.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  28.43 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1192  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 490 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  24.91 
 
 		 542 aa  51.2  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  30.6 
 
 		 290 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  27.61 
 
 		 273 aa  51.2  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  25.52 
 
 		 320 aa  50.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  21.92 
 
 		 507 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  25.84 
 
 		 540 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  26.13 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  27.74 
 
 		 262 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 525 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>