14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0069 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0559  hypothetical protein  39.16 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3060  hypothetical protein  37.95 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  34.73 
 
 		 668 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  34.73 
 
 		 680 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  34.19 
 
 		 199 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  31.85 
 
 		 199 aa  90.1  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  32.26 
 
 		 199 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  32.91 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 203 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.57 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  30.66 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0277  hypothetical protein  30.47 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  25 
 
 		 185 aa  42.7  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>