254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0147 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 668 aa  1390    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  72.39 
 
 		 680 aa  1025    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  51.82 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  30.12 
 
 		 693 aa  198  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  30 
 
 		 688 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  30.02 
 
 		 670 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  29.32 
 
 		 669 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  27.75 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  43.01 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  41.18 
 
 		 203 aa  146  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  29.31 
 
 		 480 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  27.54 
 
 		 517 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  27.8 
 
 		 612 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  25.78 
 
 		 535 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  25.78 
 
 		 535 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  25.56 
 
 		 539 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  39.35 
 
 		 199 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  25.87 
 
 		 539 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  36.26 
 
 		 203 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  27.9 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  25.05 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  36.09 
 
 		 199 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  25.56 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  24.84 
 
 		 545 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  26.25 
 
 		 519 aa  127  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  25.47 
 
 		 527 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  25.33 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  25.38 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  25.82 
 
 		 521 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  27.81 
 
 		 533 aa  124  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  25.55 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.25 
 
 		 645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  34.73 
 
 		 656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  26.28 
 
 		 507 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  25.79 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  25.12 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  24.27 
 
 		 546 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  26.4 
 
 		 502 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 480 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 503 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  34.73 
 
 		 367 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 477 aa  101  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.33 
 
 		 258 aa  98.2  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 675 aa  93.2  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  21.78 
 
 		 522 aa  90.9  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  22.35 
 
 		 511 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  22.35 
 
 		 511 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  22.35 
 
 		 511 aa  87  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0559  hypothetical protein  32.26 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3060  hypothetical protein  30.32 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  23.46 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  23.49 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0277  hypothetical protein  38.32 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  22.01 
 
 		 520 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  22.73 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  22.03 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  22.58 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  22.47 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  21.48 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  25.49 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  22.54 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  26.14 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  22.54 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  22.54 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  23.02 
 
 		 541 aa  65.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0894  proline iminopeptidase  27.46 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  23.11 
 
 		 525 aa  63.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  21.31 
 
 		 524 aa  63.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  30.1 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  20.92 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  24.89 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1915  response regulator receiver domain-containing protein  25.62 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0435196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  27.34 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1033  proline iminopeptidase  26.44 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  21.85 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  22.22 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  24.09 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  23.62 
 
 		 508 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  30.88 
 
 		 313 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  28.37 
 
 		 317 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 489 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  19.57 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  29.41 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  28.78 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  29.41 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  21.37 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  25 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  21.26 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  29.8 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  28.15 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  28.15 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  24.46 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  30.94 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  28.49 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1180  proline iminopeptidase  27.54 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  0.812597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  19.6 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7145  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>