25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1810 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  84.85 
 
 		 199 aa  349  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  83.84 
 
 		 199 aa  345  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  60.61 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  38.99 
 
 		 680 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  40 
 
 		 668 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  30.69 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3060  hypothetical protein  32.12 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0559  hypothetical protein  29.59 
 
 		 332 aa  99  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0008  hydrolase, alpha/beta fold family protein  30.38 
 
 		 258 aa  94.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0069  hypothetical protein  31.85 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0277  hypothetical protein  26.38 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  28.65 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  29.07 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  24.86 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  28 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  29.07 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  25.15 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  25.29 
 
 		 268 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  22.82 
 
 		 537 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  27.91 
 
 		 302 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  33.33 
 
 		 351 aa  44.7  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  24.14 
 
 		 537 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  22.99 
 
 		 437 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  24.14 
 
 		 537 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>