50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1104 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  58.21 
 
 		 290 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  58.39 
 
 		 273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  56.6 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  59.77 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  40.16 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  35.93 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  39.64 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  39.64 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  38.01 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  36.88 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  30.53 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  38.64 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  30.51 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  30.56 
 
 		 296 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  29.44 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  25.43 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  29.52 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  24.72 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  26.2 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  26.63 
 
 		 576 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  25.29 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  30.61 
 
 		 560 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  30.89 
 
 		 566 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0091  hypothetical protein  23.53 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.164093  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  26.4 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  28.73 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.58 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2399  hypothetical protein  31.46 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00252121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  39.19 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  28.12 
 
 		 537 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  27.13 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  28.12 
 
 		 537 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  27.27 
 
 		 387 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1730  hypothetical protein  35 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  29.45 
 
 		 537 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  28.74 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  32 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  32.94 
 
 		 189 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  40 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  36.99 
 
 		 185 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3661  alpha/beta fold family hydrolase  24.55 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1472  hypothetical protein  24.78 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00176011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  29.06 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1613  hypothetical protein  21.47 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0837629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  30.59 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3018  hypothetical protein  30.23 
 
 		 238 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  27.13 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  31.82 
 
 		 307 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>