42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1411 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  85.76 
 
 		 302 aa  530  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  41.94 
 
 		 351 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  30.9 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  26.72 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  31.14 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  31.16 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  24.06 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1432  hypothetical protein  37.04 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4663  hypothetical protein  31.54 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  27.56 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_003296  RS03125  hypothetical protein  28.28 
 
 		 537 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.516059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10680  hypothetical protein  25.42 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1810  hypothetical protein  27.91 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  32.61 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  27.2 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4146  hypothetical protein  26.92 
 
 		 537 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1220  putative secreted protein  26.22 
 
 		 387 aa  49.3  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789164  normal  0.0187345 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4034  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 537 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1489  hypothetical protein  33.72 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  0.0687577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3216  hypothetical protein  24.8 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.383094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  26.87 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4429  hypothetical protein  37.23 
 
 		 135 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.978681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2694  periplasmic protein-like protein  28.87 
 
 		 576 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1106  hypothetical protein  26.16 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  24.85 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  38.1 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3386  hypothetical protein  37.89 
 
 		 446 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  38.1 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0974  hypothetical protein  24.29 
 
 		 189 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3695  hypothetical protein  37.89 
 
 		 445 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.555947 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  26.88 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  28.21 
 
 		 417 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  28.15 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0958  periplasmic protein-like protein  26.12 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  23.24 
 
 		 560 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1526  periplasmic protein-like protein  26.83 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352336  normal  0.908264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  22.6 
 
 		 566 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3577  hypothetical protein  38.89 
 
 		 444 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>