26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2400 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2400  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.39497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1755  periplasmic protein-like protein  41.54 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5186  hypothetical protein  27.4 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4903  periplasmic protein-like protein  28.67 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.96318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5203  hypothetical protein  26.01 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.297257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3874  hypothetical protein  28.38 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3657  periplasmic protein-like  24.86 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1655  hypothetical protein  29.26 
 
 		 307 aa  62  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3116  hypothetical protein  27.42 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0789557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1327  hypothetical protein  28.15 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  24.26 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3250  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334982  normal  0.501006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2182  hypothetical protein  26.42 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172075  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  24.06 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2817  hypothetical protein  26.15 
 
 		 560 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260933 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5219  periplasmic protein-like  28.98 
 
 		 437 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3085  hypothetical protein  24.77 
 
 		 566 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0811  hypothetical protein  30.77 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407181  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  25.15 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  22.92 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  23.57 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3411  periplasmic protein-like  26.09 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.456273  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  25.87 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  25.87 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  23.24 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>